Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNE4Q8N205 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms