Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC47Q8N1G4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms