Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms