Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG4DQ86TL0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms