Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms