Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HS2ST1Q7LGA3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms