Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP50Q70EL3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP50Q70EL3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms