Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms