Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN1Q6NZI2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms