Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms