Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms