Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms