Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms