Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC18Q5T9S5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms