Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIF1Q5T3J3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms