Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD3Q5JSP0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms