Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF6Q58WW2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCAF6Q58WW2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCAF6Q58WW2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCAF6Q58WW2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF6Q58WW2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms