Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFT2D3Q587I9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFT2D3Q587I9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms