Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF212Q495C1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms