Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms