Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms