Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms