Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KNOP1Q1ED39 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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