Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME3Q16798 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME3Q16798 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ME3Q16798 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME3Q16798 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME3Q16798 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME3Q16798 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME3Q16798 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ME3Q16798 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME3Q16798 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME3Q16798 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME3Q16798 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME3Q16798 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME3Q16798 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME3Q16798 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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