Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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NDUFA9Q16795 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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NDUFA9Q16795 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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NDUFA9Q16795 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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NDUFA9Q16795 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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NDUFA9Q16795 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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NDUFA9Q16795 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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NDUFA9Q16795 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFA9Q16795 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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