Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NTRK2Q16620 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK2Q16620 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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