Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LY6EQ16553 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms