Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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VAMP3Q15836 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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