Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SF1Q15637 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SF1Q15637 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SF1Q15637 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SF1Q15637 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SF1Q15637 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SF1Q15637 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SF1Q15637 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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