Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF1AQ15573 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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