Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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