Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDC1Q14676 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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