Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCNIQ14094 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNIQ14094 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms