Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNASE1L3Q13609 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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