Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIGQ13278 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIGQ13278 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIGQ13278 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIGQ13278 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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