Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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