Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKAA1Q13131 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKAA1Q13131 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKAA1Q13131 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKAA1Q13131 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKAA1Q13131 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKAA1Q13131 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKAA1Q13131 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PRKAA1Q13131 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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PRKAA1Q13131 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PRKAA1Q13131 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PRKAA1Q13131 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PRKAA1Q13131 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PRKAA1Q13131 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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PRKAA1Q13131 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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PRKAA1Q13131 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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PRKAA1Q13131 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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PRKAA1Q13131 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PRKAA1Q13131 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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