Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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