Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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