Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK2Q13002 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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