Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTP4A2Q12974 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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