Protein–RNA interactions for Protein: Q12962

TAF10, Transcription initiation factor TFIID subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF10Q12962 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF10Q12962 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms