Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STX4Q12846 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STX4Q12846 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STX4Q12846 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STX4Q12846 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms