Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFEMP1Q12805 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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