Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWF1Q12792 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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