Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms