Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD3Q0VAK6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms