Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNA1Q09470 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNA1Q09470 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms