Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4CQ08493 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms