Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GOLGA3Q08378 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GOLGA3Q08378 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms